Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms