Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB4P16144 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB4P16144 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB4P16144 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB4P16144 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB4P16144 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB4P16144 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms