Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms