Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TPRP12270 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TPRP12270 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TPRP12270 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms