Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2BP0DI82 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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