Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2P0DI81 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms