Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSP90AB1P08238 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms