Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFLP07196 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEFLP07196 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFLP07196 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms