Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG5P05408 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG5P05408 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG5P05408 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms