Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK1O94907 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK1O94907 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK1O94907 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms