Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XRCC2O43543 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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