Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNJ1O43426 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms