Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA2O43364 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA2O43364 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms