Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLOCKO15516 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms