Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNMO15061 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNMO15061 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNMO15061 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms