Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD8O14715 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms