Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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