Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PATL2C9JE40 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms