Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms