Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWA8A3KMH1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms