Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCYT1BQ9Y5K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCYT1BQ9Y5K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCYT1BQ9Y5K3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms