Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF6Q9Y4K3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF6Q9Y4K3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms