Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC1Q9Y3B2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC1Q9Y3B2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms