Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM2Q9Y333 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LSM2Q9Y333 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms