Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1DQ9Y2S0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1DQ9Y2S0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1DQ9Y2S0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms