Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM2Q9Y2K5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM2Q9Y2K5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM2Q9Y2K5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms