Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SBNO2Q9Y2G9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SBNO2Q9Y2G9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBNO2Q9Y2G9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SBNO2Q9Y2G9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms