Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF3IP3Q9Y228 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP3Q9Y228 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms