Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SETD1BQ9UPS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SETD1BQ9UPS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SETD1BQ9UPS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SETD1BQ9UPS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms