Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX6Q9UPM6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX6Q9UPM6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms