Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACSIN2Q9UNF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACSIN2Q9UNF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACSIN2Q9UNF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN2Q9UNF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms