Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS4AQ9UN37 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4AQ9UN37 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4AQ9UN37 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms