Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF112Q9ULX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF112Q9ULX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF112Q9ULX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms