Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLCQ9ULV8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBLCQ9ULV8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms