Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNRF3Q9ULT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNRF3Q9ULT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNRF3Q9ULT6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNRF3Q9ULT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms