Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDRG4Q9ULP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms