Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH3Q9ULD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH3Q9ULD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH3Q9ULD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms