Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AMFRQ9UKV5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AMFRQ9UKV5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms