Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRTO4Q9UKD2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms