Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTBP2Q9UKA9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTBP2Q9UKA9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTBP2Q9UKA9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms