Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMP5Q9UJQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMP5Q9UJQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms