Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBF1Q9UH73 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EBF1Q9UH73 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF1Q9UH73 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms