Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms