Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK4Q9UBT3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK4Q9UBT3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms