Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MGAT4CQ9UBM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MGAT4CQ9UBM8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1022.1 ms