Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC50.42■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC50.4■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC50.4■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC50.4■■■■■ 5.66
CCDC180Q9P1Z9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC50.36■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC50.34■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC50.33■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.65
CCDC180Q9P1Z9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC50.31■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC50.3■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC50.29■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.27■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC50.26■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC50.25■■■■■ 5.64
CCDC180Q9P1Z9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.24■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC50.22■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.22■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC50.22■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC50.21■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
CCDC180Q9P1Z9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC50.18■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC50.18■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC50.18■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.16■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC50.15■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC50.14■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC50.13■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC50.13■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC50.13■■■■■ 5.62
CCDC180Q9P1Z9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC50.12■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC50.11■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC50.11■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC50.1■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC50.1■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC50.1■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms