Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP4Q9P0V3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4Q9P0V3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms