Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINJ2Q9NZG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINJ2Q9NZG7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms