Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED29Q9NX70 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms