Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAK1IP1Q9NWT1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAK1IP1Q9NWT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAK1IP1Q9NWT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAK1IP1Q9NWT1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAK1IP1Q9NWT1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms